Жителите на Кресна и неправителствени организации заявиха категоричното си нежелание Автомагистрала Струма да премине през Кресненското дефиле чрез дълъг тунел. Според местните хора много по-безопасно би било в дефилето да бъдат построени няколко по-къси тунела. Освен това местният бизнес в района ще пострада, твърдят хората. В Кресна са убедени, че тунел с дължина около 18 километра през дефилето ще донесе много опасности, поради това, че районът е сеизмична зона. От няколко неправителствени организации заявиха, че дългият тунел в дефилето крие риск от радиация, обезлесяване и земетресения. В този район излиза на повърхността радиоактивния газ радон, който е като уран, без цвят и мирис и би проникнал през пукнатините, натрупвайки огромна концентрация, което ще се поеме от човешкия организъм и затова хората са против дълъг тунел през дефилето.